Se esperaba que el borrador de 16 páginas fuera vendido hasta en US$ 1.5 millones en la casa de subastas Christie's.
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McLean había insinuado en febrero que el manuscrito original revelaría el significado de las letras de la canción, que siempre ha sido un misterio.
"La escritura y las letras van a divulgar todo lo que hay a divulgar", dijo.
El músico de 69 años, había dicho antes que el principio de la canción habla de la muerte de los músicos Buddy Holly, Ritchie Valens y Big Bopper -Jiles P Richardson- en un accidente aéreo en 1959, pero ha sido difícil entender el resto de la letra.
El misterio ha hecho a "American Pie" uno de los temas más debatidos en la historia de la música.
McLean dijo que escribir la canción fue "un viaje místico en su pasado".
El cantante informó que la decisión de vender el manuscrito, que incluye varios borradores con notas manuscritas y supresiones, en un capricho.
La canción de ocho minutos, fue número uno en Estados Unidos durante cuatro semanas.
Madonna también lanzó una versión de la canción en el año 2000 que encabezó las listas en muchos países.
